Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PPARDQ03181 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PPARDQ03181 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms