Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms