Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPCQ01831 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms