Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRF9Q00978 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms