Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms