Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms