Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms