Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX1P83916 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX1P83916 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms