Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCL20P78556 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL20P78556 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCL20P78556 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CCL20P78556 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL20P78556 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CCL20P78556 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CCL20P78556 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CCL20P78556 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CCL20P78556 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCL20P78556 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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