Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P61574 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms