Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CABP4P57796 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CABP4P57796 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms