Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP107P57740 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms