Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms