Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRPF1P55201 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRPF1P55201 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms