Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEMP55040 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEMP55040 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEMP55040 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEMP55040 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEMP55040 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GEMP55040 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GEMP55040 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GEMP55040 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms