Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HK3P52790 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HK3P52790 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HK3P52790 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HK3P52790 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms