Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms