Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms