Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK8P49336 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK8P49336 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK8P49336 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK8P49336 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms