Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms