Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRCC3P46736 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms