Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACADSBP45954 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms