Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms