Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBRP36941 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms