Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNA7P36544 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CHRNA7P36544 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms