Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FLT4P35916 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FLT4P35916 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FLT4P35916 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FLT4P35916 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FLT4P35916 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FLT4P35916 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms