Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSF2RBP32927 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms