Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms