Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB4P30926 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms