Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms