Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms