Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2E2P29084 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms