Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GCAP28676 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GCAP28676 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCAP28676 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCAP28676 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCAP28676 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCAP28676 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCAP28676 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms