Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMBRP28336 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMBRP28336 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMBRP28336 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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