Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB5P28074 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMB5P28074 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms