Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms