Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LMO1P25800 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LMO1P25800 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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