Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms