Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSSP25774 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSSP25774 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSSP25774 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms