Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
XPAP23025 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
XPAP23025 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
XPAP23025 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XPAP23025 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms