Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERBB3P21860 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms