Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF3P18847 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF3P18847 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms