Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRG2P13727 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms