Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF35P13682 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms