Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms