Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODC1P11926 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms