Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR2F1P10589 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NR2F1P10589 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms