Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NGFRP08138 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NGFRP08138 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NGFRP08138 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms