Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK1P06493 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms