Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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